「Yakult（ヤクルト）1000」のシリーズ品として、目で確認しやすく、端的で、呼びやすい、「Yakult（ヤクルト）」の頭文字「Ｙ」をつけた「Ｙ１０００」（ワイセン）としています。

豆乳からつくられていることがわかりやすく、また、豆乳が持っている優れた力を引き出した商品であることを表現するため、「豆乳の力」と名づけました。

「Yakult（ヤクルト）1000」に比べてカロリー・糖類をオフした商品であることがわかりやすいように「Yakult（ヤクルト）1000 糖質オフ」と名づけました。

「Ｙ１０００ 糖質オフ」は、「Ｙ１０００」に比べてカロリー・糖類をオフした商品であることがわかりやすいように「Ｙ１０００ 糖質オフ」と名づけました。

乳酸菌 シロタ株が含まれていることに加えて3種のビタミンなど不足しがちな栄養成分を一緒に摂れることから「ヤクルト マルチビタミン」と名づけました。

なお、2025年4月のリニューアル以前は「ヤクルトファイブ」という名前でしたが、商品特長やプラスアルファの付加価値を有することがより伝わりやすいように、商品名を「ヤクルト マルチビタミン」に変更いたしました。

2013年11月のリニューアル（菌数増加、賞味期限延長、価格改定）に伴い、「ヤクルト」「ヤクルトカロリーハーフ」が新しくなったことを想起しやすいように商品名に「New」を加えました。

また、「Newヤクルトカロリーハーフ」については、「Newヤクルト」に比べ、糖質・カロリーともに50％低減されているという商品特長がより伝わりやすいよう、2025年6月に商品名を「Newヤクルト 糖質・カロリー50％オフ」に変更しました。

「Yakult（ヤクルト）1000」は宅配専用商品であるのに対して、「Ｙ１０００」は店頭専用商品です。

また、内容量、菌数、販売価格（メーカー希望小売価格）などが異なります。

なお、「Yakult（ヤクルト）1000」は、商品を使用した飲用試験での結果を機能性の根拠としているのに対して、「Ｙ１０００」は、「Yakult（ヤクルト）1000」での飲用試験の結果に基づく研究レビューを根拠に機能性表示を行っているため、届出表示の文言に違いがあります。